Вайссман был одним из первых, кто прибыл в лабораторию Лос-Аламос в штате Нью-Мексико для работы над <Проектом Манхэттен> - разработки первой ядерной бомбы. <Он говорил о своей работе в Лос-Аламос со смешанными чувствами, часто вспоминая реакцию его деда Бенджамина: <Сэм, мир не готов к той штуке, которую ты построил>, - сказал журналистам сын ученого - профессор физики в Университете Иллинойса Майкл Вайссман. После того, как ядерное оружие было испытано и началось его масштабное производство, Вайссман работал в составе разных групп активистов, выступая против ядерной войны. С 1946 года до конца жизни он работал в Университете Вашингтона.