Одно из расследований касается способности к взаимодействию с другими программами целого ряда продуктов, в том числе Microsoft Office. Также под подозрение антимонопольных органов попал Internet Explorer. В ЕС намерены расследовать, насколько законно внедрение браузера в Windows.
В сентябре 2007 года американская компания вынуждена была заплатить полмиллиарда евро штрафа, проиграв ЕС апелляционное разбирательство в суде. Чиновники Евросоюза смогли доказать, что продажа вместе с Windows медиа-плеера Windows Media Player нарушает принципы свободного рынка. Также Евросоюз выражал недовольство тем, что Microsoft взимает плату с разработчиков-конкурентов за доступ к подробной информации о взаимодействии различных программ с Windows. Американская компания вынуждена была сократить плату до символического единоразового платежа.
